Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的预后生物研究课题

2021-11-15 02:33:41 来源:
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这项研究课题旨在确定一种可以数据研究食管鳞状细胞癌(ESCC)病征整体而言生存率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO取得119名ESCC病征的miRNA理解谱及其相应的临床信息,并将其作为专业训练集。在早期和后半期样本间筛选差异性理解的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox重归研究、递归特征抑制(RFE)-支持向量座机(SVM)算法和LASSO Cox重归数学模型来定位病因普遍性miRNAs,从而建立病因评价数学模型。此外,数据研究了这些病因普遍性miRNAs的有前途靶等位基因,然后借助于了miRNA靶等位基因互联网。通过功用钼研究,研究了ESCC中的这些病因普遍性miRNAs数据研究靶等位基因的功用涉及普遍性。

在专业训练之外,早期与后半期样本有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的不确定普遍性评价数学模型。该5-miRNA不确定普遍性评价可以将专业训练集分为OS短时间引人注意不同的高危组和低危组。在一个来自乳腺癌等位遗传物质图谱(TCGA)的独立数据之外,尝试验证了5-miRNA不确定普遍性评价的不确定普遍性分层能力。已确定了与这些miRNAs涉及的各种生物学过程和自营,例如Wnt信号自营、TRP通道的炎症介质调节自营和睾酮信号自营。

这项研究课题提示,与病理分期涉及的5-miRNA标签对数据研究ESCC病征的病因具有临床意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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