Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功相符地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2022-01-31 00:50:01 来源:
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亦同,一项登载在国际杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的数据分析报告中所,来自欧洲分子生物学Laboratory等机构的地质学家们通过数据分析将本能大肠有机体小组中所所有已知的病原体DNA小组概要成了一个大型的数据库,从而就能鼓励数据分析医护人员深入即使病原体DNA和细胞内之间的关联,以及其对本能生活品质的不良影响。

病原体遍布肝细胞以外,其并不需要造成了细胞内质来不良影响EVA消化、生活品质和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体有机体小组成员的数量要要强生殖细胞还要多,都有病原体、真菌和其它有机体;为了理解病原体在本能生物学中所所充当的关键角色,地质学家们通常会在Laboratory中所分立并对其培育,随后在对病原体展开DNA测序,然而在此之前很多病原体还未在Laboratory的周围环境中所被培育繁殖。

为了拿到这些病原体的具体信息,数据分析医护人员采取了另以外一种分析方法,他们从周围环境中所(比如大肠)得来基本上检验,随后在对整个检验中所的DNA展开测序,然后利用计算机分析方法对来自基本上检验中所的数千种物种的个体DNA小组展开重建,这种分析方法被称之为祥DNA小组学技术,该技术能作为一种替代分析方法对单个物种的DNA展开分立和测序。

数据分析者Rob Finn坚称,去年都有我们在内的三个独立团队重建了成千上万个大肠有机体小组DNA小组,而仅次于的缺陷就是这些团队所取得的结果前提不具可比性,以及前提能将这些结果概要成为一个非常全面的清单。在此之前数据分析医护人员现在从本能大肠中所大约4600种病原体群落中所概要了20万个DNA小组和1.7亿个细胞内质核苷酸,这种新型的数据库(标准化的本能胃大肠DNA小组交集和标准化的胃大肠细胞内质录入)揭示了EVA大肠的极大多样性,并为进一步展开大肠有机体小组数据分析铺平了柏油路。

数据分析者绘制出的这个极大的录入是有机体小组数据分析的一个里程碑,预见或将能为地质学家们提供非常宝贵的海洋资源来数据分析本能大肠生态系统中所每一种病原体所充当的关键角色。这项数据分析表明,大约70%被样品到的病原体从而在Laboratory中所被成功培育过,而其在体内的活性仍然推断出,而这类病原体中所仅次于的群体就是Comantemales;数据分析者坚称,看到Comantemales如此较广实在一个惊喜,这就不言而喻了我们的确对大肠中所的病原体大相径庭,我渴望这个录入能鼓励生物信息学家和分子生物学家在预见几年毕竟这一科学空白。

该数据库/录入得来的所有数据都能在离线海洋资源Mgnify中所拿到,其能鼓励地质学家们分析有机体的DNA小组数据并且与举例来说的数据库展开对比;随着在世界上数据分析团队不断发布最初数据库,该录入但会扩大到都有其它EVA口腔的有机体小组,比如皮肤或口腔内部等口腔。最后数据分析者坚称,这一录入的概要预见或为有机体学家和临床数据分析医护人员提供非常丰富的海洋资源,然而数据分析医护人员但会在南美洲、亚洲和非洲等代表性不足的地区挖掘出更多最初病原体物种,在此之前数据分析医护人员并不清楚不同人群中所病原体多样性的不同和发生变化情况。

原始注解:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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